Проектом изменений в госпрограмму предполагается исключение из целей госпрограммы ускоренного импортозамещения по ряду продуктов и внесение некоторых новых целей, к числу которых планируется отнести обеспечение населения страны безопасной сельскохозяйственной продукцией и продовольствием, повышение конкурентоспособности сельхозпродукции российского производства на внутреннем и внешнем рынках, устойчивое развитие сельских территорий, обеспечение занятости, повышение уровня жизни и квалификации сельского населения. Дополнительно формулируется новая цель - устойчивое земледелие, сохранение и воспроизводство используемых АПК природных ресурсов.

Из целей госпрограммы планируется исключить обеспечение продовольственной безопасности в определенных Доктриной продовольственной безопасности параметрах, повышение финансовой устойчивости предприятий АПК, обеспечение эпизоотического благополучия территории РФ, а также обеспечение сбыта и рост товарности сельхозпродукции за счет создания условий для ее сезонного хранения и переработки.

Среди новых задач госпрограммы развития АПК планируется внести реализацию экспортного потенциала отечественной сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия.

Также проектом предусмотрено внесение изменений в части финансирования госпрограммы в 2018 – 202 годах и приведение в соответствие с федеральным бюджетом на 2017 год и на плановый период 2018-2019 годы и корректировка темпов роста, исходя из новых объемов финансирования.